Otros Recursos

Enlaces de interés Tema 1

• Variables de entorno: https://www.hostinger.es/tutoriales/variables-de-entorno-linux
• Comandos Unix: https://www.unixtutorial.org/basic-unix-commands
• MD5SUM: https://www.gnu.org/software/coreutils/manual/html_node/md5sum-invocation.html
• Comando Grep: https://www.gnu.org/software/grep/manual/grep.html

Enlaces de interés Tema 2

• Formato GFF: https://gmod.org/wiki/GFF2
• Format BED: https://www.ensembl.org/info/website/upload/bed.html

Enlaces de interés Tema 3

• Vectores: https://rstudio-pubs-static.s3.amazonaws.com/752914_8a4f67e3f35f46c795b19929891b79b5.html#vectores
• Matrices y marcos de datos : https://rstudio-pubs-static.s3.amazonaws.com/752914_8a4f67e3f35f46c795b19929891b79b5.html#manipulaci%C3%B3n-de-datos-i-parte
• Importar y exportar datos : https://rstudio-pubs-static.s3.amazonaws.com/752914_8a4f67e3f35f46c795b19929891b79b5.html#importar-y-exportar-datos

Enlaces de interés Tema 4

• Bucles: https://www.datacamp.com/tutorial/tutorial-on-loops-in-r
• Bucles2: https://intro2r.com/loops.html
• Funciones personalizadas : https://fhernanb.github.io/Manual-de-R/creafun.html

Enlaces de interés Tema 5

• ggplot2: https://rpubs.com/anlope10/562981

Enlaces de interés Tema 6

• Paquete limma para análisis de arrays: https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/limma/inst/doc/usersguide.pdf
• Técnicas de secuenciación masiva: https://moodle.unican.es/pluginfile.php/2537958/mod_resource/content/1/NGS_2008.pdf
• Aplicaciones NGS: https://moodle.unican.es/pluginfile.php/2537959/mod_resource/content/1/Next-generation_sequencing_2015.pdf

Enlaces de interés Tema 7

• Secuenciación de genoma en cáncer: https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2758710/pdf/ddp396.pdf
• Formato SAM: https://moodle.unican.es/pluginfile.php/2537972/mod_resource/content/1/SAM1%20%282%29.pdf
• Explain SAM Flags: https://broadinstitute.github.io/picard/explain-flags.html

Enlaces de interés Tema 8

• Métodos de ensamblaje: https://training.galaxyproject.org/training-material/topics/assembly/tutorials/algorithms-introduction/slides-plain.html
• Gráficos de Bruijin: https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5531759/
• Blast: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

Enlaces de interés Tema 9

• Normalización: https://www.youtube.com/watch?v=ecjN6Xpv6SE
• Corrección multitest: https://www.youtube.com/watch?v=HLzS5wPqWR0
• PCA: https://www.youtube.com/watch?v=fkf4IBRSeEc
• DESeq2: https://moodle.unican.es/pluginfile.php/2538004/mod_resource/content/1/DESeq2.pdf

Enlaces de interés Tema 10

• scATAC-seq: https://www.10xgenomics.com/products/epi-atac
• 4C: Benchmarking of 4C
• MACs: https: https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/gb-2008-9-9-r137